Nastava se u školi i za razrednu i za predmetnu nastavu od 2015. godine odvija u prijepodnevnoj smjeni, ali sa dva različita rasporeda (tjedan A i tjedan B).

Učenici razredne nastave koriste cijelu godinu istu učionicu, dok se učenici predmetne nastave sele prema rasporedu sati. Nastavu tjelesne kulture imaju na sportskim terenima ili u Športskoj dvorani. Za učenje stranog jezika mogu odabrati Njemački ili Engleski jezik ili Ruski jezik i kultura..

Glazbenu kulturu učenici iz četvrtog razreda matične škole pohađaju u kabinetu glazbene i likovne kulture a učenici iz Cirkovljana u svom razredu u školi na Trgu svetog Lovre. Vjeronauk kao izborni predmet slušaju kod svoje Vjeroučiteljice u svojim razredima.

Predmetna nastava je organizirana kabinetski pa učenici od 5. do 8. razreda svaki ili svaki drugi odmor odlaze na nastavu u drugi kabinet.